2.1翻译启动元件预测及鉴定

IRES是一种具备招募核糖体并实现核糖体组装和后续阅读框翻译蛋白的RNA调控元件，能够使蛋白质翻译起始不依赖于5‘帽结构直接翻译[22-24]。一开始这种IRES区域是在广泛的病毒RNA[25, 26]（最早在小RNA病毒5'-UTR）和一些真核细胞mRNA中被发现，有报道表明约10%的mRNA的5’-UTR能够通过IRES募集核糖体[27]。由于高等真核生物的基因组和细胞调节网络的复杂性，IRES通常检测较为困难。IRESs主要出现在它们控制的开放阅读框上游的5'UTRs中，但也有例外。有些在开放阅读框之间，有些在开放阅读框以内[28-30]。细胞中的IRES序列与病毒相比通常活性和效率也都较低，但具有良好且可靠的特征[31, 32]。IRES介导的翻译的选择性调节在一定程度上参与细胞生长、增殖、分化、应激反应和凋亡调控等生理或病理过程[24, 33, 34]。IREs网站预测：IRESite、IRESfinder、IRESPred 、IRSS、VIPS等等。

双荧光素酶等报告实验可以证明IRES活性，从而预测ncRNA的编码能力[35]。