2.3 PyFoxl2 氨基酸序列同源性及进化树分析

     从NCBI数据库里选择7个Foxl2代表性的物种的氨基酸序列进行同源比对分析，结果发现PyFoxl2与软体动物的氨基酸序列相似度较高，其中与栉孔扇贝(Chlamys farreri)、欧洲大扇贝(Pecten maximus)的相似性最高，分别为98%、96%，与美洲牡蛎（Crassostrea virginica）的相似性为73%。图中画横线为保守的FH结构域，红色方框为核定位信号序列（图2）。

    为了解Foxl2在不同物种中的进化关系，使用MEGA 7.0软件的Neighbor-joining 法对18个物种构建系统进化树，结果显示软体动物聚为一支，无脊椎动物软体动物聚为一支,节肢动物门单独分出一支。其中虾夷扇贝先与栉孔扇贝、长牡蛎（Crassostrea gigas）、合浦珠母贝(Streptodera trachelostropha)等聚为一支，这显示它们的亲缘关系较近，形成的独立分支再与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)聚为一支，最后与脉红螺(Rapana venosa)聚为一支，为软体动物门。