2.1匙指虾科线粒体基因组的特征分析
由表1可见，匙指虾科24个物种线粒体基因组的长度在15 318 bp（加尔西氏匙指虾）和16 430 bp（伊莎贝拉洞穴虾）之间，24个匙指虾科物种AT含量最低的为62.20%（墨西哥洞穴虾），AT含量最高的为70.19%（彼氏匙指虾），高AT含量在十足动物中普遍存在。另外，24个匙指虾科物种线粒体基因的排列顺序完全相同，说明匙指虾科物种在进化中相当保守。
2.2匙指虾科线粒体基因组的差异位点分析
由表2可见，匙指虾科线粒体基因组的15个基因中，7个基因（nd6、atp8、nd2、nd4L、nd5、nd4和nd3）变异位点比例超过60%，6个基因（rrnL、rrnS、atp6、nd1、cox2和cob）变异位点比例在50%～60%，cox1和cox3基因的变异位点比例最低，为46.22%和48.85%。变异位点数最多的是nd5基因（1098个），其次是nd4和cox1基因（分别为842个和703个），然而cox1基因变异位点比例较低，不适用于群体遗传分析，nd5和nd4基因变异位点比例高，基因长度长，而且变异位点多，因此可作为匙指虾科理想的分子标记，用于分析不同群体间的生物多样性。
