新型冠状病毒及咳嗽相关靶点按照大于平均自由度值进行筛选
更新日期:2021-04-01     浏览次数:288
核心提示:新型冠状病毒及咳嗽相关靶点按照大于平均自由度值进行筛选,筛选两次后得到26个核心基因靶点。将26个核心基因靶点输入至STRING数据库,将单独靶点隐藏

新型冠状病毒及咳嗽相关靶点按照大于平均自由度值进行筛选,筛选两次后得到26个核心基因靶点。将26个核心基因靶点输入至STRING数据库,将单独靶点隐藏后,得到蛋白PPI网络图。该网络图共有26个节点,164条相互作用关系,平均度值为12.6(见图2)。将PPI网络数据导入 Cytoscape3.2.1中(如图3所示),得到的26个核心靶点,按度值降序排列为AKT1、JUN、CASP3、TP53、CAT、IL1B、PTGS2、ESR1、LEP、EDN1、HSP90AA1、CASP9、IGF1、PPARG、APOE、RELA、NOS2、BAX、CYP2E1、FAS、BCL2、PRKACA、ADRB2、SLC6A4、ALDH2、NPPA。可以分析得出度值最大的为AKT1、度值为21;其次是JUN,度值为20;CASP3的度值为20;TP53度值为20;CAT度值为18。度值越大表示该靶点越重要,这些靶点可能是宣肺止咳方治疗COVID-19的关键靶点。

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