差异基因分析—预测潜在生物学标志
更新日期:2021-04-20     浏览次数:179
核心提示:3.1差异基因分析预测潜在生物学标志为进一步明确DEGs之间相互作用,通过构建PPI网络,应用Cytoscape中NetworkAnalyzer工具计算节点属性,筛选出相互作

3.1差异基因分析—预测潜在生物学标志

为进一步明确DEGs之间相互作用,通过构建PPI网络,应用Cytoscape中NetworkAnalyzer工具计算节点属性,筛选出相互作用紧密的重要节点基因:CXCL1、CXCL3、CXCL5、CXCL13、CCL19、CCL20、CCL25、CCR7、PNOC、GPR18、GPR183、CXCR2。除CCL25为下调基因,其他都为过表达。这些基因主要涉及免疫反应、炎症反应、对脂多糖的反应、趋化因子介导的信号通路、中性粒细胞趋化性的正向调节等生物学过程。其中CXCL1、CXCL3、CXCL5、CXCL13、CCL19、CCL20、CCL25为趋化因子家族[8],它们的任务主要负责募集炎症组织中的白细胞,在炎症反应中起关键作用。趋化因子由CL、CCL、CXCL和CX3CL4四个亚家族组成,相对应的受体有10余种,由CCR和CXCR两个亚家族组成。现代研究CXCL5与CXCR2结合介导血管增生,与慢性炎症、肿瘤增殖转移密切相关[9]。CXCL3与CXCR2结合激活相关细胞通路影响肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移[10]。因此,趋化因子及其受体可能成为设计各种Hp相关性胃肠疾病治疗策略的潜在靶点。