1. 部分农业硕士研究生培养结果与培养目标不符合，毕业专业学位研究生知识多停留在书本上，缺乏实际操作能力。2.部分农业硕士与学术学位研究生培养界限模糊，有的几乎没有区别。3. 部分农业硕士学科、专业、领域界限模糊，夸领域甚至跨学科培养的现象严重。4.农业硕士缺乏统一专业实践标准及考核依据，过于怀柔的考核政策导致导师与研究生普遍不重视专业实践。