使用CytoNCA插件对网络进行拓扑学分析
更新日期:2021-05-07     浏览次数:170
核心提示:1.3靶点蛋白相互作用网络的构建及核心靶点筛选对马钱子苷预测靶点和T2DM的差异表达基因取交集,获得马钱子苷治疗T2DM的潜在作用靶点,在Cytoscape_3.7

1.3 靶点蛋白相互作用网络的构建及核心靶点筛选

对马钱子苷预测靶点和T2DM的差异表达基因取交集,获得马钱子苷治疗T2DM的潜在作用靶点,在Cytoscape_3.7.2软件中构建药物-靶点-疾病网络。使用Cytoscape软件插件BisoGenet检索靶点蛋白间相互作用并构建靶点蛋白相互作用网络(protein protein interaction,PPI)网络,使用CytoNCA插件对网络进行拓扑学分析,点度中心性(Degree Centrality,DC)、中介中心性(Between Centrality,BC)和接近中心性(Closeness Centrality,CC)是网络核心节点的常用评价方法,本文筛选满足DC中位数2倍值、BC中位数和CC中位数等卡值要求的靶点作为核心靶点。

2024-11-13• 基于网络药理学及实验验证探索七福饮和当归芍药
审稿意见一、稿件基本信息评价题目与主题:题目基于网络药理学及实验验证探索七福饮和当归芍药散治疗阿尔茨海默病同病异治作用机制准确且具体地描述了...
2024-10-23• 基于网络药理学的五味消毒饮治疗痤疮的机制研究
基于所提供的文档《基于网络药理学的五味消毒饮治疗痤疮的机制研究.docx》,以下是从审稿专家的角度给出的详细审稿意见:审稿意见一、文章整体评价本...
2024-10-16• 基于网络药理学和分子对接探讨宣白承气汤“肺肠
审稿意见一、文章总体评价本文基于网络药理学和分子对接技术,深入探讨了宣白承气汤加味在治疗肺炎链球菌和流感病毒(IV/SPN)共感染中的潜在作用机制...
2024-10-15• UPLC-QqQ-MS/MS结合网络药理学研究通降合剂治疗
审稿意见文件名:《UPLC-QqQ-MS/MS结合网络药理学研究通降合剂治疗反流性食管炎的作用机制》投稿期刊:《上海中医药杂志》审稿专家意见一、总体评价本...
2024-10-10• 基于网络药理学初步探讨疏肝健脾解毒方防治肝癌
审稿意见文章标题: 基于网络药理学初步探讨疏肝健脾解毒方防治肝癌作用机制作者: 郭晨旭, 马学东单位: 上海市闵行区古美社区卫生服务中心审稿意见:一...
2024-09-29• 淫羊藿苷靶向基因与阿尔茨海默病之间的交叉途径
投稿期刊: 《黑龙江中医药》审稿专家意见:研究背景与意义:文章选题新颖,将淫羊藿苷(ICA)与阿尔茨海默病(AD)联系起来,探讨其潜在的治疗机制,...
2024-08-14• 基于网络药理学及分子对接探讨开心散改善阿尔茨
审稿意见一、总体评价本文基于网络药理学和分子对接技术,结合动物实验验证,系统地探讨了开心散(Kaixin San)对阿尔茨海默病(AD)的治疗作用及其潜...
2024-07-30• 转录组学联合网络药理学探讨柴胡-白芍治疗肝郁
审稿意见标题:转录组学联合网络药理学探讨柴胡-白芍治疗肝郁脾虚型抑郁的机制作者:于莎莎,耿少辉,付婧媛,姜懿津,叶子,肖恩凡,黄光瑞投稿期刊...
2024-07-29• 基于网络药理学与分子对接探究宣肺振心方治疗射
审稿意见一、稿件概述本文题为《基于网络药理学与分子对接探究宣肺振心方治疗射血分数保留型心力衰竭的作用机制》,作者赵百浩等人通过网络药理学和分...
2024-07-23• 基于数据挖掘和网络药理学的中药治疗弱精子症用
审稿意见一、总体评价本文《基于数据挖掘和网络药理学的中药治疗弱精子症用药规律及作用机制分析》系统地探讨了中药治疗弱精子症的用药规律及其潜在作...