两个群体有类似的等位基因，且频率相似，彼此的遗传距离较小，说明他们的共同起源比较近^[23]。根据45对引物扩增产物的聚丙烯酰氨凝胶电泳图谱数据，计算出84份大麦供试种质材料SSR标记遗传距离。本研究中84份大麦材料间的遗传距离为0.1818～0.8864，平均值约为0.6142，表明多数大麦种质间遗传差异较大，亲缘关系相对较远。在84份大麦种质两两间遗传距离比较中发现，WDM07900和美国24、Z0901M061M以及ZO3V003W遗传距离分别为0.8864、0.8636、0.8636，遗传相似度低，适合做杂交组合；美16/I和美11/I、12-P108和美18/I间遗传距离分别为0.1818、0.2500，两者间亲缘关系最近，不适合做杂交组合，也说明目前所选的45对分子标记不足以明显区分开这些材料，需要继续挖掘代表性标记。

对参试的84份大麦种质材料，采用PowerMarker v3.25软件进行聚类，结果表明：由甘肃省农科院提供的84份大麦种质材料分为6个亚群，BON07-28等16份大麦材料聚为一类；ZD2730887等27份大麦材料单独聚类；美4/I等14份大麦材料单独聚类；12DE06等2份材料聚为一类；其余的25份材料分为两类-Z1920057W等12份材料分为一类，美16/I等13份材料聚为一类。同时利用构建进化树得到的聚类图结果，将为育种家选择优良的杂交组合提供可行的方案。