蛋白质相互作用网络的中心节点
更新日期:2021-07-20     浏览次数:193
核心提示:3.2 GO和KEGG富集途径分析在NAFLD和COPD中以P值0.05为阈值,对34个常见基因进行了功能富集和KEGG通路分析。GO生物学过程(BP)的变化主要包括中性粒细

3.2 GO和KEGG富集途径分析

在NAFLD和COPD中以P值<0.05为阈值,对34个常见基因进行了功能富集和KEGG通路分析。GO生物学过程(BP)的变化主要包括中性粒细胞活化参与免疫反应、中性粒细胞介导的免疫、先天免疫反应的调节。细胞组分(CC)的变化主要集中于富含纤胶凝蛋白 1 颗粒体膜、内腔及第三颗粒管腔。此外,在分子功能(MF)部分,糖基化终产物受体结合、模式识别受体活性、碳水化合物结合模块均发生了显着变化。尤其是,KEGG途径的变化主要集中在病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、C型凝集素受体信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用。

3.3 PPI网络分析和核心基因选择

为了明确共有基因的相互关系,构建了PPI网络。蛋白与其他蛋白具有相互作用被认定为较关键基因,是蛋白质相互作用网络的中心节点。中心基因的具体作用程度,发现互作蛋白信息较少,利用信息挖掘扩展网络。我们选择相互作用大于2的蛋白作为关键靶点用于进一步研究。