2.1 菌种培养及细菌基因组 DNA 提取
各阳性菌株经NB活化纯培养后平板培养基分离,挑取单个菌落于10 ml无菌试管中摇菌12 h,取1 ml细菌纯培养液,按通用型DNA提取试剂盒提取各细菌基因组DNA。用K5500超微量分光光度计测定各细菌DNA模板的浓度和纯度,并计算DNA拷贝数。DNA模板于-20 ℃下保存备用。
分别以目标菌株和供试菌株的基因组DNA为模板进行扩增。反应体系:2×M5 GoldStar TaqMan Mixture 10 μL,上下游引物各0.6 μL,探针0.4μL,DNA模板2μL,ddH2O补足至20 μL。引物和探针浓度为10mMol/μL。反应参数:95 ℃预变性15 min;95 ℃变性3 s,60 ℃退火并延伸30 s,40个循环,在每个循环的退火延伸阶段收集荧光信号。以NB培养液为阴性对照,无菌超纯水为空白对照。