1.2.6蛋白互做网络分析
STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes) 是EMBL开发的蛋白质互作数据库,该数据库从最有力的实验验证导数据的挖掘、同源预测的蛋白质互作关系都有收录。
对蛋白质相互作用及其网络的了解不仅有助于深入理解生命活动的本质和疾病发生的机制,而且可以为药物研发提供可能的靶点。因此,利用生物信息学的手段研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,包括蛋白质相互作等 用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究等。我们将差异表达基因映射到相应的蛋白互做网络中,提取子网并对其可视化,并根据基因在整个网络中的拓扑性质来筛选关键的基因。