对所有产品的优质序列长度进行统计
更新日期:2021-08-23     浏览次数:128
核心提示:2.2测序序列分析所有产品总共得到718846条有效序列,经过过滤和去除嵌合体之后得到39231条优质序列;对所有产品的优质序列长度进行统计,结果表明序列

2.2  测序序列分析

所有产品总共得到718846条有效序列,经过过滤和去除嵌合体之后得到39231条优质序列;对所有产品的优质序列长度进行统计,结果表明序列长度分布在210-518bp范围内,将所得OUT分别分类到门、纲、目、科、属及种的数量进行统计。

2.3  稀释曲线

稀释曲线可以直观的反应样品的测序深度情况,当稀释曲线随着测序序列的增加而升高,表明继续测序还可能产生较多新的OUT,当曲线趋于平坦时再增加测序深度对发现新的OTU的可能性很小,此时说明测试数据量合理,能满足测序质量要求。可知多数样本在序列数在5000-10000时,观察到的OTU数目已经接近饱和;说明测序数据量合理,现有测序量已经可以反映出产品中微生物群落丰度信息。

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