1.3.3 粪便中基因组DNA的提取  

粪便采集后1周内采用OMAGE公司的Stool DNA Kit进行基因组DNA的提取。先将含有粪便保存液的粪便进行离心，弃去上清，取200mg沉淀并根据试剂商的说明进行DNA的提取。将200mg粪便样品放到2ml离心管中经过SP1重悬后，70℃处理10min以裂解细菌，95℃再次处理5min用以裂解革兰阳性菌等含有较厚细胞壁的细菌。加入SP2沉淀去除杂质，转移上清液，加入Buffer BL和乙醇后上柱结合基因组DNA，经过两次快速洗涤离心，最后用100ul Elution Buffer 洗脱基因组DNA，用核酸定量分析仪进行DNA浓度以及纯度的检测，并用琼脂糖凝胶电泳进行DNA完整性检测，将检测合格的DNA保存于-20℃冰箱备用。