1.3基因差异表达分析
应用R语言加载limma扩展包[3]进行基因差异表达分析,筛选差异表达基因。本研究根据|logFC|>1和校正的P值<0.05筛选差异表达基因。加载pheatmap扩展包[4],绘制差异基因热图。
1.4基因本体论(GO)富集分析
GO从三个方面对基因的本质进行描述,生物学过程(Biological Process, BP),分子功能(Molecular Function, MF),细胞组分(Cellular Component, CC)。本研究应用clusterProfiler扩展包[5]中的enrichGO函数对获得的差异基因进行GO富集分析。