对获得的差异基因进行GO富集分析
更新日期:2022-01-14     浏览次数:186
核心提示:1.3基因差异表达分析应用R语言加载limma扩展包[3]进行基因差异表达分析,筛选差异表达基因。本研究根据|logFC|1和校正的P值0.05筛选差异表达基因。加

1.3基因差异表达分析

应用R语言加载limma扩展包[3]进行基因差异表达分析,筛选差异表达基因。本研究根据|logFC|>1和校正的P值<0.05筛选差异表达基因。加载pheatmap扩展包[4],绘制差异基因热图。

1.4基因本体论(GO)富集分析

GO从三个方面对基因的本质进行描述,生物学过程(Biological Process, BP),分子功能(Molecular Function, MF),细胞组分(Cellular Component, CC)。本研究应用clusterProfiler扩展包[5]中的enrichGO函数对获得的差异基因进行GO富集分析。

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