节点的 degree 值对节点进行大小和颜色的标注
更新日期:2022-01-20     浏览次数:322
核心提示:2.2 健脾化痰方化合物-靶点网络构建及相互作用分析 利用 Cytoscape3.6.1 软件将 267 个化合物与对应靶点构建化合物⁃靶点网络,经 删除重复靶点,共取

2.2 健脾化痰方化合物-靶点网络构建及相互作用分析 利用 Cytoscape3.6.1 软件将 267 个化合物与对应靶点构建化合物⁃靶点网络,经 删除重复靶点,共取得 371 个节点(203 个化合物节点,168 个成份靶点节点)和 5078 条边。 其中三角形节点代表化合物,圆形节点代表对应的靶点,每条边代表化合物与靶点之间的相 互作用关系。图中根据节点的 degree 值对节点进行大小和颜色的标注,颜色越红,代表节 点 degree 值越大,节点越大代表节点的 degree 值越大,在网络中 degree 值的大小反应了网 络中节点的重要程度,取大于两倍 degree 均值的节点,共得到 40 个重要节点,前 5 位活性 化合物主要为槲皮素、山奈酚、β-谷固醇、异鼠李碱等,前 5 位靶点主要为雄激素受体、 雌激素受体、前列腺素 G/H 合酶 2、一氧化氮合酶、过氧化物酶体增殖物激活的γ受体等, 从图中我们可以看到活性成份 MOL000098(槲皮素)的 degree 值最高,而靶点中 AR 和 ESR1 等节点 degree 值较高,表明这些靶点即是健脾化痰方作用比较广泛的几个靶点。 

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