KEGG通路分析主要富集在细胞因子受体相互作用
更新日期:2022-05-20     浏览次数:133
核心提示:最新的研究成果,本论文的主要观点为目的:利用转录组测序分析挖掘与舌鳞状细胞癌(TSCC)发展相关的关键基因,旨在筛选TSCC的候选生物标志物,同时分

最新的研究成果,本论文的主要观点为目的:利用转录组测序分析挖掘与舌鳞状细胞癌(TSCC)发展相关的关键基因,旨在筛选TSCC的候选生物标志物,同时分析其与Treg之间的关系及临床意义。方法:收集5例病人的舌癌及癌旁组织,进行建库测序及差异表达分析,GO和KEGG分析差异基因的功能及相关通路,PPI蛋白质网络和Cytoscape鉴定枢纽基因,生存分析确定核心基因为CCL20,组织学水平验证CCL20及Treg的表达水平,统计分析CCL20、Treg的表达及临床意义。结果:本研究共鉴定出40766个基因,通过差异表达分析筛选,其中上调的有313个,下调的有189个。GO分析表明DEGs与补体激活经典途径有关,KEGG通路分析主要富集在细胞因子受体相互作用。PPI和Cytoscape筛选出前9个关键基因,分别是CXCL10 ,CSF2,MMP9,CCL7,CCL20,CXCL9,CXCL13,CD80,CXCL11。生存分析提示CCL20在TSCC的OS密切相关。免疫组化验证CCL20在癌组织中表达较高,同时与组织学分级及其肿瘤神经侵犯有关。CCL20的表达与Treg存在相关性。结论:CCL20可能成为TSCC的潜在生物标志物,通过招募Treg向肿瘤周围募集,参与TSCC的发生发展。不知是否符合录用要求,望您批评与指正。

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