人体是一个共生微生物的载体，有超过人体细胞总数十倍的微生物，广泛分布于人体各个部位，在肠道中有上千种微生物定植，消化道居住的大量微生物被统称为肠道微生物群。正常的肠道微生物群以其所处的宿主人类的微环境共同构成了肠道微生态 [3]。肠道微生态又被统称为肠道菌群，这些细菌大致分为三类：有益菌、有害菌、中性菌。在机体健康情况下，各菌属之间相互拮抗并依存，这种关系称为肠道定植抗力（(colonization resistance,CR)），CR正常，肠道菌群则保持着相对平衡的状态[4, 5]。一旦体内外环境发生变化，肠道菌群也随之改变，如菌群多样性的变化、优势菌群的减少和条件致病菌的增多，从而导致肠道功能紊乱以及多种肠内外疾病的发生。