2017—2021年成都市猫细小病毒的检测及其VP2基因的变异分析
更新日期:2022-06-10     浏览次数:282
核心提示:《畜牧兽医学报》2022年 第4期|周群杨苑宋鑫何欣怡曹慧张斌西南民族大学畜牧兽医学院成都610041青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部/四川省重点实验

 
《畜牧兽医学报》2022年 第4期 | 周群 杨苑 宋鑫 何欣怡 曹慧 张斌   西南民族大学畜牧兽医学院 成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部/四川省重点实验室 成都610041
摘 要:本研究旨在通过对成都地区家养猫细小病毒(feline parvovirus,FPV)的分子检测,了解FPV在成都地区的流行及遗传变异情况。2017-2021年分别从四川成都地区采集168份家养猫的腹泻粪便样本,用PCR方法对168份样本进行FPV检测,并选取13份阳性样本进行VP2基因全长的克隆和测序,用MegAlign软件分析FPV核苷酸和氨基酸序列的同源性及变异,通过MEGA 7.0软件用邻近法构建系统进化树分析成都地区FPV的遗传进化情况。结果表明,168份猫样本中检出FPV阳性样本118份,阳性率为70.2%。本研究获得的13株FPV VP2基因与参考毒株之间的同源性为97.1%~100%。VP2蛋白氨基酸分析表明,SMU-D18和SMU-D14毒株序列与new CPV-2a一致,为猫源犬细小毒株。有趣的是,本研究中SMU-D46毒株在第293和297位氨基酸均出现了独特的由Ser(S)到Phe(F)的替换。此外,系统进化分析显示,国内外FPV毒株在进化树中聚类为3个基因群(G1、G2和G3),本研究获得的毒株分别位于G1和G3群中,值得注意的是,商品化的FPV疫苗株位于G2群中,与我国流行的FPV毒株亲缘关系较远。本研究表明,成都市猫群中FPV的流行十分普遍,急需重新评估现有的商品化疫苗的保护效率。
【分 类】 【农业科学】 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学 > 单股DNA病毒
【关键词】 猫细小病毒 分子流行病学 VP2基因 变体
【出 处】 《畜牧兽医学报》2022年 第4期 1303-1309页 共7页