1.4 PPI网络构建与功能Gene ontology (GO) 注释及通路富集分析Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)
将1.3获得的交集靶点利用STRING,其实置信度得分高于0.4为显著相关。结果在Cytoscape软件中进行可视化分析,CytoHubba插件进行差异基因的上调及下调基因中关键基因的筛选,取Degree算法得分,分别选取得分前10个基因确定为关键基因。
DAVID数据库进行GO功能分析,包含了生物过程(biological process,BP)、细胞成分(cellular component,CC)和分子功能(molecular function,MF)3个功能类别,同时进行KEGG通路富集分析。