基于TCGA和GTEx数据库RNA测序表达数据在线分析和挖掘的网站 [7,8]。本研究利用GEPIA 数据库在线分析ACLY在LIHC患者肝癌组织与正常肝组织中的表达情况,ACLY表达对在LIHC患者总生存期(overall survival, OS)和无病生存期(disease-free survival, DFS) 的影响。
1.3 HPA数据库
一个利用转录组学和蛋白组学技术从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达情况的数据库[9],由组织图谱、细胞图谱、病理图谱、血液图谱、脑图谱和代谢图谱6部分组成 [10]。本研究利用HPA 数据库进一步分析正常肝组织和癌组织中ACLY蛋白表达水平,分析ACLY蛋白表达与患者生存率之间的相关性,Kaplan-Meier 生存分析评估患者的预后。
1. 4 String数据库
已知蛋白质和预测蛋白质之间相互作用的数据组成的数据库,可在线分析、预测蛋白质之间调控网络。本研究通过String数据库分析ACLY 共表达基因所调控的蛋白质互作网络。