《谷子CDPK基因家族全基因组序列鉴定及进化分析》为作者：魏萌涵最新的研究成果，本论文的主要观点为钙依赖蛋白激酶（CDPK）是一类主要的钙信号感受器，对钙信号的感知和解码起重要调控作用，为揭示CDPK在谷子生长发育和抗逆防御机制中的作用，本研究利用生物信息学的方法，从谷子基因组中鉴定出28个SiCPKs基因，对这些家族成员的基因结构、系统进化、染色体定位、基因复制及其所编码的蛋白的理化性质进行系统生物信息学分析。结果表明，本研究所鉴定出的28个SiCPKs基因所编码的氨基酸长度在51。82 KDa-68。32 KDa之间，等电点在4。97-9。01之间，氨基酸序列绝大多数含有4个EF-Hand功能域且高度保守；基因结构预测结果表明，大多数SiCPK基因均含有6-8个外显子，染色体定位结果表明，28个SiCPKs基因分别定位在8条染色体上，其中，9号色体上最多（6个），4号色体上没有；为了进一步分析谷子和其他物种的同源进化关系，构建了谷子与拟南芥、水稻、莱茵衣藻、小立碗藓的CDPK进化树，发现莱茵衣藻与小立碗藓单独聚类，谷子与水稻的亲缘关系比拟南芥近；共线性分析表明，谷子与水稻基因间存在串联重复和片段重复，它们是谷子CDPK家族成员扩张的主要动力。综上所述，谷子28个CDPK基因在进化上分为4个亚家族，基因结构的复杂程度与进化树聚类存在联系，串联复制是基因家族成员扩增的进化途径之