2.2 细菌菌群结构
分析山区段和城市段水体中门水平细菌菌群的结构(图2a)。山区段水体中优势菌门主要以变形菌门(32.21%)、拟杆菌门(20.33%)、放线菌门(14.22%)和蓝藻菌门 (Cyanobacteria, 10.90%)为主,城市段水体中优势菌门主要以变形菌门(33.70%)、酸杆菌门(Acidobacteria, 18.89%)、绿弯菌门(Chloroflexi, 12.04%)、放线菌门(8.00%)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes, 7.51%)为主。
从PCoA分析可以看出山区段和城市段菌群结构被分在2个区域,之间具有差异性(见图3a)。有研究表明,水体中细菌菌群的代谢和结构极易受到外界因素(如pH、溶解氧和碳氮等营养物质)的影响[20, 21]。本结果可以看出,由于山区段受到人为污染较少,细菌菌群结构相对稳定;城市段中各采样点之间菌群结构分布较为分散,存在一定的差异性,这可能是由于城市区不同河流段所接纳污染源不同而导致的[22]。基于ANOSIM分析(图4a),山区段和城市段之间的菌群结构有显著差异性(R=1, P=0.001),进一步验证上述结果。
大汶河上游山区段和城市段中(a)门水平OTU和(b)ARG型的组成 (MLS:大环内酯类-林可胺类-链霉素类)
Figure 2 The profile of (a) OTU at the phylum level and (b) ARGs in upper mountain section and urban section of Dawen River (MLS: Macrolide-lincosamide-streptogramin)
大汶河上游山区段和城市段之间(a)OTU和(b) ARG亚型组成差异性PCoA分析 (彩色圈代表不同组别95%置信区间)
Figure 3 Principal coordinate analysis (PCoA) plots show the composition differences of (a) OTU and (b) ARG subtype between upper mountain section and urban section of Dawen River (Colored circles show the 95% confidence intervals of different groups)
大汶河上游山区段和城市段中(a)OTU和(b) ARG亚型的组成差异性ANOSIM分析