肺鳞癌与腺癌基因表达谱的特征及对比分析
更新日期:2020-12-11     来源:中国肺癌杂志   作者:郭姜艳  浏览次数:242
核心提示:最新的研究成果,本论文的主要观点为[目的] 利用基因芯片技术筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因,探讨肺鳞癌与肺腺癌基因表达谱特征,分析出新的基因

最新的研究成果,本论文的主要观点为[目的] 利用基因芯片技术筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因,探讨肺鳞癌与肺腺癌基因表达谱特征,分析出新的基因表达谱来区分肺鳞癌与肺腺癌,同时为探索新的肺癌标志物提供线索。 [方法] 1、选取14例昆明医科大学第一附属医院外科肺癌手术切除标本,术中冰冻及术后病理证实为6例肺鳞癌及癌旁组织,8例肺腺癌及癌旁组织。用TRzol提取人肺鳞癌、肺腺癌及相应癌旁组织的RNA,用Cy3-dCTP标记,合成cDNA探针,再与含41000个基因的微阵列杂交,筛选表达倍数≥3倍及P-value≤0。05的数据作为差异表达基因,得出肺鳞癌和肺腺癌基因表达谱。2、分析比较肺鳞癌、肺腺癌及其对应癌旁组织的基因表达谱,寻找肺鳞癌表达上调和下调基因、肺腺癌表达上调和下调基因。3、根据GO分析提供的信息,筛选与肺器官发育高度相关基因,挑选与肺组织器官特异或相对特异的基因。 [结果] 1、肺鳞癌与癌旁组织比较,共有差异表达基因1155个,其表达上调基因355个,表达下调基因800个;其中MMP12、SPP1、NTRK2、DLX6、UCHL1、ADAM23、STRA6、GREM1、MMP11、KRT(14,16,17)等上调,BPIFB1、PIP、FOLR1、CDH19、ANXA3、KRT(13,24)等下调。 2、肺腺癌与癌旁组织比较,共有差异表达基因3560个,其表达上调基因1781个,表达下调基因1779个;其中MAGEA6、HMGA2、SPINK1、EDN2、GSTT1、MMP1、MMP10、KRT(7,8,18,80, 6A,6B)、RUNX1、CDH10等上调,RPS4Y1、DAPL1、SFTPC、CYP2B6、 KAL1、KRT6C等下调。 3、肺腺癌与肺鳞癌比较,有490个差异表达基因在肺鳞癌与肺腺癌中共同表达,其中表达上调135个,表达下调355个。剔除其共同表达基因,肺鳞癌中特异性表达基因有665个,表达上调220个,表达下调445个;肺腺癌中特异性表达基因有3070个,表达上调1646个,表达下调1424个。提示肺腺癌的基因表达谱与肺鳞癌的基因表达谱存在较大差异。 4、根据GO分析,筛选出SFTPD、NKX2-1、AGER、PTHLH、TCF21、PDPN与肺组织器官发育高度相关基因。 [结论] 1、肺鳞癌、肺腺癌与正常肺组织基因表达有明显差异,肺鳞癌、肺腺癌的基因表达谱也存在较大差异,表明肺鳞癌与肺腺癌在肿瘤发生、发展中可能存在不同机制,可能是两种不同类型肺癌不同生物学行为的分子基础,进一步研究 肺鳞癌、肺腺癌中的特异表达基因,可能为研究肺鳞癌与肺腺癌的分子分型及其不同特征提供有价值的线索。 2、MMP12、MMP11、Keratin 19、SPP1、NTRK2、DLX6、UCHL1、ADAM23、STRA6、GREM1、BPIFB1、PIP、FOLR1、ANXA3、KRT(13,14,16,17,24)等与肺鳞癌关系较为密切。 3、NKX2-1、MAGEA6、HMGA2、SPINK1、EDN2、GSTT1、MMP1、MMP10、KRT(7,8, 18,6A,6B,6C)、RPS4Y1、DAPL1、SFTPC、CYP2B6、KAL1等与肺腺癌关系较为密切。 4、490个基因同时在肺鳞癌与肺腺癌中出现差异表达。提示多个基因在肺癌的发生、发展中起作用,尤其是这490个基因可能是肺鳞癌与肺腺癌发生、发展的关键基因,如MMP1、MMP2、MMP9、TIMP1、DLX6、TNC等,进一步分析研究有望成为肺癌早期诊断,靶向治疗与预后判断提供分子标志物候选基因。 5、决定肺组织器官相对特异基因有5个,SFTPB、AGER、PTHLH、TCF21与PDPN等基因。 [关键词] 基因芯片 肺肿瘤 基因表达谱 基因。不知是否符合录用要求,望您批评与指正。