差异基因的生存分析
更新日期:2022-01-17     浏览次数:163
核心提示:1.3 AMIGO2与胰腺癌患者生存关系的研究Kaplan-Meier Plotter数据库的数据来源包括GEO、EGA和TCGA。该工具的主要目的是基于荟萃分析对生物标记物与肿瘤

1.3 AMIGO2与胰腺癌患者生存关系的研究

Kaplan-Meier Plotter数据库的数据来源包括GEO、EGA和TCGA。该工具的主要目的是基于荟萃分析对生物标记物与肿瘤患者的生存和预后进行发现和验证[21]。我们采用该数据库中泛癌分析中的mRNA测序数据,分析了胰腺癌中AMIGO2与患者的整体生存期和无复发生存期的关系。

GEPIA2数据库可用于肿瘤与正常组织差异基因分析的在线工具,可以进行差异基因的生存分析。我们通过该数据库分析了AMIGO2与胰腺癌患者生存的相关性。

1.4 AMIGO2基因与TP53基因突变的相关性研究

基于TCGA数据库中31种癌症类型的3级RNA-seq和临床数据的交互式网络资源。 可用于分析肿瘤与正常样本之间感兴趣的潜在基因的相对转录表达以及转录表达与相关临床病理参数的关联[22]。本研究通过UALCAN数据库对TP53突变和野生型胰腺癌中AMIGO2的mRNA表达差异进行了研究。

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