膳食纤维是食物中不被宿主吸收的多糖，能选择性地促进体内有益菌的代谢和增殖，改善宿主健康。可溶性膳食纤维如果胶、瓜尔胶和一些菊粉等，不溶性膳食纤维如纤维素、半纤维素、果聚糖、抗性淀粉等^[4]，它们存在于全谷物（如燕麦、小麦）、豆类（如扁豆、豌豆）、种子和坚果（如亚麻仁），以及一些水果和蔬菜（如苹果、胡萝卜、花椰菜、芹菜)^[5]中。

膳食纤维经肠道菌群高度发酵与膨胀，主要在结肠^[6]产生短链脂肪酸(SCFAs)，含乙酸、丙酸和丁酸以3:1:1的比例，占SCFAs 90-95%^[7]，这些短链脂肪酸被肠道菌群或被宿主作为营养。在整个胃肠道细菌数量分布差异大，食道和胃里的细菌数量很低，在结肠中细菌数量最高，每克粪便有10¹² ~ 10¹⁴个细菌，400~1000种类。

膳食纤维不仅会直接影响宿主体内肠道菌群组成，同时也会通过影响宿主的新陈代谢和免疫系统，间接地塑造肠道菌群，改变肠道菌群的多样性，增加SCFAs产量^[6,7]，使厚壁菌门和拟杆菌门的比例发生变化^[8]。