疾病交集靶点进行生物功能和通路的富集分析
更新日期:2022-02-25     浏览次数:201
核心提示:1.3 黄连-茵陈成分与室性早搏靶点 PPI 网络构建将茵陈、黄连有效成分的作用靶点取并集,去除重复项,与疾病的靶点取交 集,所得结果即为药物与疾病的

1.3 黄连-茵陈成分与室性早搏靶点 PPI 网络构建
将茵陈、黄连有效成分的作用靶点取并集,去除重复项,与疾病的靶点取交
集,所得结果即为药物与疾病的共有靶点。将交集靶点导入 STRING 数据库
(https://string-db.org)构建蛋白互作(PPI)网络模型,限定物种为“Homo
sapiens”,得到 PPI 网络,利用 Cytoscape3. 7. 2 软件中的 MCODE 进行分析,
得到黄连-茵陈治疗室性早搏(PVB)的潜在子网。
1.4 GO 功能和 KEGG 通路富集分析
将黄连-茵陈治疗室性早搏的作用靶点录入 metascape 平台,限定物种为
“Homo sapiens”,设置 P<0.01,分析其生物功能及通路并进行富集分析,导出
数据并对其进行可视化分析,以此来预测黄连-茵陈治疗室性早搏的作用机制。