活性成分与核心靶点具有较好的结合性
更新日期:2022-03-14     浏览次数:327
核心提示:1.2消瘀康胶囊活性成分的收集与靶标蛋白的预测利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)[10]检索消瘀康胶囊组成药物的相关化学成分,通过相关文献

1.2 消瘀康胶囊活性成分的收集与靶标蛋白的预测

利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)[10]检索消瘀康胶囊组成药物的相关化学成分,通过相关文献对化学成分进行补充。以生物利用度(oral bioavailability,OB ≥ 30%)和类药性(Drug-likeness,DL ≥ 0.18)[11]为条件筛选其活性成分,得到活性成分的集合。通过TCMSP数据库搜集相关活性成分对应的靶标蛋白,利用Uniprot 蛋白数据库的 UniProKB进行标准化处理,转化成人源性标准基因名后进行靶标蛋白的基因名查询,整合得到消瘀康胶囊活性成分的靶点。

1.3 脑出血疾病相关基因的获取

以英文名“Cerebral haemorrhage”和“ICH”为关键词,通过GeneCards[12]、OMIM[13]、PharmGkb、TTD、DrugBank 5个数据库进行筛选,收集 “脑出血”疾病的相关基因,再将所得结果合并及删除重复项后,获得已明确的疾病相关基因。

1.4 消瘀康胶囊治疗脑出血潜在作用靶点及“活性成分-作用靶点”网络构建

利用Venny平台对消瘀康胶囊的作用靶点和脑出血的疾病靶点进行映射,所得交集基因即为消瘀康胶囊治疗脑出血的潜在作用靶点。再利用Cytoscape3.8.0软件绘制活性成分-作用靶点网络图,并根据度值筛选出关键活性成分。