比较了甲醇、乙腈两种不同流动相B对PFOS、PFOA峰形和响应值的影响，对于全氟化合物而言，乙腈做流动相时的洗脱强度高于甲醇做流动相时的洗脱强度，乙腈做流动相时毛刺少，峰形较窄，因此最后选择乙腈作为流动相B。流动相A中加入乙酸铵有利于全氟化合物的离子化，比较了3 mmol/L和5 mmol/L两种不同浓度乙酸铵作流动相A时的目标化合物峰形，当乙酸铵浓度为5 mmol/L时，两种全氟化合物的峰形最好，峰高最高。通过梯度洗脱可以使2种全氟化合物在10.5 min内有效分离，具有良好的分离度。