反应产物用琼脂糖凝胶电泳检测
更新日期:2022-03-26     浏览次数:185
核心提示:1.4 RAPD 扩增DNA提取参考谭琦等(2001)的方法。RAPD反应采用20种上海生物工程中心合成的随机引物,即S12、S8、S10、S12-S19、S42-S44、S47、S59、S6

1.4 RAPD 扩增

DNA提取参考谭琦等(2001)的方法。RAPD反应采用20种上海生物工程中心合成的随机引物,即S12、S8、S10、S12-S19、S42-S44、S47、S59、S60和OPA02、OPA03、OPA05。

PCR反应体系见表1。反应程序为,92℃变性5 min,然后92℃变性1 min,35℃复性1 min,72℃延伸2 min,重复此循环45次。最后72℃补平5 min。反应结束后,反应产物用琼脂糖凝胶电泳检测,观察电泳结果并拍照。

1.5 聚类分析

统计聚丙烯酰胺凝胶电泳中的同工酶条带和琼脂糖凝胶电泳中的DNA条带,用NTSYS-PC软件中的Simqual程序计算大球盖菇不同菌株间相似系数,然后用平均连锁聚类分析方法(UPGMA)进行聚类分析,构建遗传相关聚类图谱。