水体中的有机成分主要有：腐殖酸、表面活性剂、细菌、油脂、有机胶体或者其他排放出的化学物质等。通常用TOC、BOD、COD等指标对有机物成分进行表征，但相应的数值只能作为反渗透进水情况的参考，并不能作为一个定量的指标（如美国海德能公司推荐的反渗透进水最大COD值为15，并不意味着当COD大于15时，就不能进入反渗透系统^[2]）。反渗透装置可以有效的去除有机物，分子量大于200的有机物可以去除99%以上，小于200的依分子量、形状、带电的不同，其去除率也不同。由有机物造成的反渗透系统故障占全部系统故障的60%-80%，发生有机污染时，系统通常表现为水通量下降，渗透压升高，如果在膜表面形成浓差极化层，还会造成脱盐率的下降，严重时易造成膜元件的机械损伤。