尽管保护环境、人权、贸易等法律制度在体制上是独立分离的，但是它们的主题是相互关联的，由于不同法律制度间追求的利益各异，因此可能发生利益冲突，这也是造成世界贸易组织法律和其他国际法律制度之间冲突的根本原因所在。不论是国家内部还是国家间政府组织，国内、国际法律规范的政治审议程序为平衡和调和相互冲突的利益提供了条件。诸如当前关于新冠疫苗知识产权豁免的国际讨论这一政治审议程序为新冠疫苗知识产权豁免制度的敲定提供平台，为调和知识产权和健康权的冲突提供路径。世界贸易组织法律的分散性既是国际法律制度的一个风险也是其特色之处，国际社会一方面强调利用法律学说和一般国际法提供的法律工具来解决潜在的规范冲突，另一方面却极力关注制度法，狭隘地关注不同主题制度法在不同行为者解决具体经济贸易投资往来事务中存在问题的功能性作用和秩序性优越，这也使得非传统安全问题日益泛化的当下矛盾突出，不成体系所产生的冲突不仅是由于缺乏信息和协调，而且往往是潜在的利益和价值冲突的表现。在农产品贸易与环境权益、烟草贸易与健康权、知识产权与健康权等方面的利益冲突尤其明显，也正是这些冲突凸显出目前国际法律秩序潜藏的利益交织和矛盾，世界无时不刻不在变化，也时时刻刻在协调。