文冠木治疗RA的靶点
更新日期:2022-04-11     浏览次数:161
核心提示:1.2 类风湿关节炎相关靶点筛选为保证数据全面,以rheumatoid arthritis为关键词,搜索GeneCards数据库[12]、Dis Ge Net数据库[13]、DrugBank数据库[14

1.2 类风湿关节炎相关靶点筛选

为保证数据全面,以“rheumatoid arthritis”为关键词,搜索GeneCards数据库[12]、Dis Ge Net数据库[13]、DrugBank数据库[14],合并去重获得RA相关靶点。其中Gene Cards、Dis Ge Net数据库基于文献构建,DrugBank数据库基于临床试验药物证据构建而成,提供了丰富的药物数据与全面的药物靶标信息,各个数据库之间各有优势、相互补充[15]。使用UniProt蛋白质数据库[16]将成分靶点与疾病靶点规范统一,使用Venny 2.1.0在线软件制作VENN图,获得文冠木治疗RA的靶点。

1.3 文冠木成分-类风湿关节炎靶点蛋白质相互作用网络(PPI)构建

将“1.2”交集靶点上传至String11.5数据库[17],选择物种“智人”,设置靶点关联的置信度为0.40,以获得PPI网络关系,并通过CytoScape3.9.0软件[18]制作PPI网络图,利用其中的MCODE插件[19]对PPI网络进行分析,得到潜在蛋白质功能模块并分析相关功能。

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