oncomine v4.5数据库是一个癌症微阵列数据库和基于web的数据挖掘平台,我们可以利用此数据库根据自己的需要设定筛选、挖掘数据的条件。首先,设定条件检索MMP1在各种肿瘤中的表达情况。然后,在本研究中,我们设定的条件是:①Gene:MMP1;②Cancer Type:Lung cancer;③Date Type:mRNA;④Analysis Type:Cancer vs. Normal Analysis;⑤阈值为:(P value<1E-4,fold change>2,gene rank=top10%。
1.2 CCLE数据库
本研究通过CCLE在线分析MMP1基因在细胞系中的表达,进一步验证本研究的可信性。
1.3进行患者生存周期分析
通过Kaplan-Meier在线数据库对MMP1表达水平对肺癌患者总体生存周期进行分析,这是一个整合了基因表达数据和临床数据库获得了包括乳腺癌、肺癌、卵巢癌和胃癌在内的生存数据以及相关基因的表达水平。