核心提示:本论文的主要观点为利用网络药理学和分子对接的方法探讨经典名方四逆散治疗昼夜节律紊乱(Circadian rhythm dysfunction)的潜在作用机制。利用TCMSP
本论文的主要观点为利用网络药理学和分子对接的方法探讨经典名方四逆散治疗昼夜节律紊乱(Circadian rhythm dysfunction)的潜在作用机制。利用TCMSP数据库预测四逆散四味中药的化合物及靶点,通过检索GeneCards数据库收集昼夜节律相关靶点,将二者进行映射获得潜在靶点;使用STRING数据库构建靶蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,运用Cytoscape 3。8。2软件构建核心靶点的基础上,建立“四逆散活性成分-潜在靶点-昼夜节律紊乱”网络;利用metascape平台对核心靶点进行KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析,研究其作用机制。利用PyMOL和AutoDock Vina等软件对四逆散关键活性成分和核心靶蛋白进行分子对接。结果显示,四逆散中411个化学成分共预测并筛选出592个药物靶点,到昼夜节律相关的基因靶点1182个,将二者进行映射,筛选出193个潜在靶点,其中四逆散治疗昼夜节律的核心靶点35个。KEGG通路分析共得到11条通路(P ≤ 0。05且benjamini ≤ 0。01),与昼夜节律紊乱关系密切的通路包括激素通路如松弛素信号通路、雌激素信号通路,以及炎症相关信号通路和MAPK信号通路。分子对接结果显示,2个关键活性成分和核心靶蛋白均有较好结合力。基于上述研究,预测四逆散可能通过干预GAPDH、IL-6、TNF以及AKT1等靶点可能干预昼夜节律紊乱。