交集靶点的PPI网络图
更新日期:2022-08-30     浏览次数:204
核心提示:2.1.2 百合乌药蒲公英汤成分筛选及靶点预测使用TCMSP、TCMIP、ETCM数据库,以口服生物利用度(OB)30%、类药性指数(DL)0.18及肠上皮吸收度(Caco-2

2.1.2 百合乌药蒲公英汤成分筛选及靶点预测

使用TCMSP、TCMIP、ETCM数据库,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性指数(DL)≥0.18及肠上皮吸收度(Caco-2)≥-0.4为限定条件,并结合参考文献筛选百合乌药蒲公英汤中百合、乌药和蒲公英的主要活性成分;通过Swiss Target Prediction和PharmMapper数据库对主要活性成分对应的靶点进行检索。

2.1.3 LF相关靶点获取

以“liver fibrosis、hepatocyte fibrosis”为关键词,通过GeneCards、OMIM、GEO数据库进行检索,删除重复靶点。

2.1.4 构建蛋白质相互作用网络(PPI)

利用Venny 2.1软件得到百合乌药蒲公英汤与LF交集靶点。将交集靶点信息导入STRING 11.0数据库进行分析,得到交集靶点的PPI网络图。

2.1.5 GO分析与KEGG通路富集分析

运用metascape数据库将得到的靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析,进一步揭示百合乌药蒲公英汤对LF的作用机制。

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