一株鸽源基因Ⅶ型新城疫强毒株的分离鉴定及全基因组分析
摘要:从疑似新城疫病毒感染的鸽群中通过鸡胚接种分离出一株新城疫病毒,将其命名为Pigeon/China/SHJD13/2017,经蚀斑纯化后测定其鸡胚平均死亡时间(MDT)为57.2 h,1日龄雏鸡脑内致病指数(ICPI)为2,毒力指标属于强毒NDV。参考Genbank公布的NDV全基因组序列,共设计了11对引物,对其进行全基因组测序,序列测定结果显示:分离株属于基因Ⅶ型NDV,其基因组全长15192bp,登录号为MK937786,F基因共包含553个aa,裂解位点的氨基酸残基为112R-R-Q-K-R-F117 ,符合NDV强毒株的分子特征。通过序列同源性比对分析,该分离株与鸡源强毒株Chicken/China/SDWF07/2011亲缘关系较近,这揭示了该鸽源分离毒株可能来源于感染的鸡群。
关键词:鸽子;新城疫病毒;基因Ⅶ型;全基因组分析